研究人員用基因測序“修正”細菌分類

澳大利亞昆士蘭大學研究人員用基因測序技術繪制出細菌進化樹，這一方法有助于改進以往的細菌分類法。

研究成果日前發(fā)表在英國《自然·生物技術》雜志上。研究人員主要使用一種被稱為元基因組學的方法，對自然環(huán)境中的細菌樣本直接進行測序，進而繪制出細菌進化樹，更好地對細菌進行分類。
現(xiàn)有的生物分類主要依據(jù)生物在形態(tài)結構和生理功能等方面的特征，以弄清不同類群之間的親緣關系和進化關系。
研究項目負責人、昆士蘭大學化學和分子生物科學學院教授菲利普·胡金霍爾茨說，盡管科學界總體認可這種根據(jù)生物進化關系來確定的分類，但因為細菌難以根據(jù)物理特征區(qū)分，所以此前對細菌的分類存在一些錯誤。

研究人員以細菌中最常見的１２０種基因圖譜為基礎繪制出龐大的細菌進化樹，以構建一個標準化的模型，修正以前的分類錯誤。

例如，按照原先的分類方法，只要是細胞內(nèi)部產(chǎn)生孢子的桿狀細菌都被歸入梭菌屬，而現(xiàn)在可以根據(jù)進化樹將梭菌屬下的細菌重新分類到２９個科的１２１個不同的屬。

研究團隊中負責軟件開發(fā)的博士多諾萬·帕克斯說，隨著生物測序技術的進步，現(xiàn)在研究人員可以獲得成千上萬種細菌的完整基因“藍圖”，包括一些目前還無法在實驗室培養(yǎng)出的細菌。